水箱過濾對改善水環境狀況起到了重大作用，但污水處理廠的尾水出路問題一直未得到解決. 許多污水處理廠將尾水直接排入天然水體,巨大的排放量超過天然水體的水環境容量，加劇水環境的污染. 因此尾水問題引起了社會各界的廣泛關注，并對尾水深度處理及排放做了大量研究 ，生物濾池、 人工濕地等尾水深度處理技術以及尾水排放系統也應運而生. 這些措施在一定程度上降低了尾水排放對自然水體的沖擊. 但是在人們關注尾水對自然水體水質產生影響的同時，卻忽略了尾水中存在的大量微生物對自然水體生態平衡及附近人群可能造成的危害.

    城市污水中含有大量的微生物，其中相當一部分為病原菌，如： 沙門氏菌(Salmonella spp.)、 志賀氏菌(Shigella spp.)、 大腸埃希氏菌(Escherichia coli)、 霍亂弧菌(Vibrio cholerae)、 金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、 弓形桿菌(Arcobacter spp.)等，可對人身體健康和社會經濟造成嚴重危害. 研究發現這些病原菌主要是人源污水微生物，污水處理工藝對其有一定去除效果，消毒可使病原菌的數量大大降低，但有些微生物生存能力強，能夠產生芽孢和孢子，難以去除. 目前對城市污水的微生物學評價多采用細菌總數和總大腸桿菌數，但糞大腸菌群與其他尾水常見病原菌相關性較低，而不能代表全部的微生物或病原菌. 國內對尾水的研究起步較晚，主要集中于消毒、 尾水排放對受納水體影響和部分回用水的微生物研究. 文獻采用定量聚合酶鏈式反應技術(qPCR)建立了尾水中某些病原菌的定量檢測方法，證實了尾水中病原菌定量檢測的可行性. 但均未對尾水微生物的群落結構進行詳細的分析.